A l'âge de 15 ans il fonde un groupe "Ekhimosis" avec lequel il enregistrera 7 albums durant les douze années de travail en commun avant de s'en aller pour Los Angeles en 1999 afin d'y entamer une carrière solo. Les talents de Juanes sont reconnus par le producteur Gustavo Santaolalla qui lui fait signer un contrat dans sa maison de disques Surco.

De cette collaboration entre les deux hommes va sortir "Fíjate Bien", le premier album solo de Juanes qui se retrouve dans les bacs des disquaires le 17 octobre 2000. C'est le son inimitable de la guitarre de Juanes avec les rythmes latinos qui va assurer le succès de l'album.

L'album est accueilli très rapidement en Amérique Latine et occuppe la première place du ranking en Colombie. Le 17 juillet 2001, Juanes est 7 fois nominé pour les Grammy Latinos. La remise des trophées aura lieu le 30 octobre et Juanes y reçoit trois prix dont celui du meilleur artiste de l'année.

En 2002, Juanes sort son deuxième album "Un día normal" dans lequel il chante en duo avec Nelly Furtado. Le titre "A dios le pido" atteint rapidement des sommets et reste 47 semaines dans le "Hot Latin Tracks" du Billboard. les autres titres de l'album comme "Es por ti", "Mala gente" et "Fotografía" chanté avec Nelly Furtado sont également des succès. L'album "Un día normal" devient disque d'or en Colombie en une seule journée de ventes !

Le 18 septembre 2002, Juanes remporte avec Nelly Furtado son quatrième Grammy latino, et le 24 octobre il enchaîne avec sa victoire comme meilleur artiste masculin de l'année aux MTV Video Music Awards.

En Novembre 2002 il entame une tournée de 17 concerts en Espagne, puis se rend à Mexico et ensuite aux Etats Unis. Juanes vole de succès en succès et rempli les salles où il donne des récitals.

Le 3 septembre 2003, le chanteur colombie remporte 5 trophées aux Grammy’s latinos et devient l'artiste latino qui a gagnée le plus de victoires la même année. Il enchaîne le 23 octobre en remportant les prix de l'artiste de l'année et du meilleur artiste rock aux MTVLA Video Music Award 2003.

En 2004 Juanes entame une grande tournée en Europe, remplissant les salles de spectacles dans des pays non hispanophones comme l'Allemagne, la France, la Suisse, la Belgique, la Hollande, le Danemark et l'Angleterre.

Cette même année, le titre " Nada valgo sin tu amor" de son troisième album "Mi Sangre" atteint immédiatement la première place des rankings. Juanes reçoit le disque de platine en Espagne, en Argentine, au Chili et bien sûr en Colombie.

En 2005 Juanes, qui donne de nombreux concerts aux Etats unis et partout dans le monde, va encore occuper la tête des hits avec sa chanson "Camisa negra". Plus d'un million deux cent mille exemplaires de "Mi sangre" sont vendus dans le monde.